مدرسه ضیائیه یا زندان اسکندر ،در سال 612 خورشیدی توسط اسکندر ب عنوان زندان ساخته،در دوره آل مظفر ،پس از ورود ب ایران ،در شهر به مدرسه تبدیل شده است.گنبد مدرسه ضیائیه،از خشت خام،از چهار دیوار بلند که طول هر یک از ضلع های ان به 8ممیز8 متر ساخته شده و گچ بریی هایی ان با ابرنگ ابی لاجوردی و طلایی تزئین شده اند.در وسط حیاط عمارت،چاهی با عمق 2ممیز8 متر از سطح زمین قرار گرفته و در انتهای چاه سردابی {زیرزمین}قدیمی،با سی و هشت پله با عمقی با پنج متر قرار دارد.در کف سرداب نیز حوضچه ای قرار دارد از بقایای عمارت اولیه مدرسه است.شبستان بزرگ مدرسه دارای محراب است و رواق های بزرگ و کوچه در جاهای مختلف زندان با معماری خاص طراحی و ایجاد شده اند،گنبدخانه مدرسه موزه سنگی از سنگ های قبور و وقف نامه های قنات یزد برپاست.