مسجد در ضلع شمال شرقی میدان گنجعلی خان واقع شده و نمازخانه کاروانسرای بزرگ مجموعه یا مدرسه مجاور بوده است.بنای مسجد،کوچک و شامل یک شبستان و ایوان ورودی است.نمای ایوان ،ساده با طرح های هندسی روی گچ کشیده شده است کف ایوان سنگی است و بربالای در چوبی آن،کتیبه ای سنگی قرار دارد.بعد از ورودی ایوان،راهرویی باریک و فضای گنبد دار شبستان با 12 نورگیر و تزئینات نقاشی،گچبری ،مقرنس کاری و کاربندی قرار دارد.محراب مسجد،با لوح مرمرین و نقش گلدان است.